要組建南方臨時政府用以對抗北洋，最主要的工作就是組建一支統(tǒng)一指揮的南方聯(lián)軍，剩下的民政事務(wù)這些都是次要的，實際上這也是無法完全南方諸省的實際民政事務(wù)統(tǒng)一，現(xiàn)在不管是陸榮廷還是唐繼堯斷然是不會把地盤交出來接受中央派遣的官員進(jìn)駐，頂多就是接任中央的對他們都任命而已，這一點不管是軍事還是民政上都是如此。

所以某種程度上來說，這三家軍閥的聯(lián)合只是名義上承認(rèn)陳敬云的中央領(lǐng)導(dǎo)權(quán)，然后實際上采用聯(lián)盟的方式形成一個統(tǒng)一的南方政府，組建南方聯(lián)軍用以對北洋作戰(zhàn)。

實際上這些相關(guān)事務(wù)早在陳敬云拉攏唐繼堯和陸榮廷的時候就已經(jīng)進(jìn)行了多次談判，并且已經(jīng)在陳敬云在南京重立國會之前就已經(jīng)取得了談判結(jié)果，重新南京國會以及后續(xù)陳敬云就職臨時政府大元帥不過是過場而已。

根據(jù)陳敬云和唐繼堯，陸榮廷三人之前達(dá)成的協(xié)議，組建南方中華民國臨時政府后，以南京為首都，以陳敬云為最高統(tǒng)帥，至于陳敬云要當(dāng)總統(tǒng)還是什么執(zhí)政又或者是總理都是他陳敬云自己的事，唐繼堯和陸榮廷沒什么心思去管，畢竟那只是一個名稱不同而已，誰敢說陳敬云當(dāng)大元帥就不是南方聯(lián)軍的最高領(lǐng)導(dǎo)人了。

除了承認(rèn)陳敬云為南方聯(lián)軍最高統(tǒng)帥外，剩下最主要的就是軍隊事務(wù)的整編安排了，南方臨時政府要和北洋在全國范圍內(nèi)全面對抗，沒有一支統(tǒng)一指揮的聯(lián)軍是不行的，雖然主力還是得靠國民軍，但是也不能缺少桂軍和滇軍的加入。

而根據(jù)陳敬云和唐繼堯、陸榮廷達(dá)成的協(xié)議，組建中央陸軍后，將會仿效國民軍現(xiàn)有的方式設(shè)置多個軍，在軍下轄數(shù)個師，負(fù)責(zé)一個戰(zhàn)線的戰(zhàn)事。由于桂軍和滇軍的數(shù)量相差有些大，所以編成的時候桂軍會得到一個軍的編制，滇軍會得到兩個軍的編制，兩者的下屬主力野戰(zhàn)部隊都會加入到這三個軍來，剩下的部分地方部隊將交由各省新設(shè)立的守備司令部管轄。而且滇軍和桂軍也不需要去改變現(xiàn)有的編制，將會保持現(xiàn)有編制不必和國民軍一樣全部編成三團(tuán)制部隊。

除了編制外，臨時政府還需要承擔(dān)一部分的滇軍和桂軍的后勤補給，主要是彈藥和其他軍事物資方面，并且陳敬云還答應(yīng)在三個月內(nèi)給他們陸續(xù)提供相當(dāng)數(shù)量的步槍，少量火炮。

這些相關(guān)談判持續(xù)了整個六月，并且在陳敬云就職大元帥之前就已經(jīng)確定了下來，所以陳敬云一就職大元帥后，立即下令整編南方各省軍隊，組建中央陸軍。

原國民軍按照原有四個軍的編制以及各師旅番號，依次改編為中央陸軍第一軍、第二軍、第三軍、第四軍。各師旅的番號也將前面的國民軍三個字去掉，換成中央陸軍，依次為中央陸軍第一師、中央陸軍第二師、中央陸軍第三師中央陸軍第十一師；中央陸軍第一混成旅、中央陸軍第二混成旅中央陸軍第五混成旅，一共十一個師，五個混成旅。警衛(wèi)師暫不列入中央陸軍行列，而改為統(tǒng)帥部直屬，正式番號為統(tǒng)帥部警衛(wèi)師。

說起來也有意思，那就是這南方聯(lián)軍的正式番號是和北洋軍的正式番號一樣的，都是中央陸軍第某某師，中央陸軍第某某混成旅。不過正式番號如此，但是人們說的時候還是沿用北洋軍，南邊的稱之為南方軍。

陳敬云的嫡系部隊國民軍番號只是變動了幾個字而已！同樣的桂軍和滇軍變動的也不大，給予桂軍的番號是中央陸軍第五軍，陸榮廷自然是軍長，原桂軍的六個師雖然是仿效的北洋編制，但是不管人數(shù)還是火力都是嚴(yán)重不足的，一個師的人數(shù)不過七八千人。如此情況下，就給了第五軍三個師的番號，分別是第十二師、第十三師、第十四師。至于陸榮廷自己怎么分配這三個師的番號那是他自己的事情。

陸榮廷也干脆，當(dāng)即就是把三個人數(shù)和裝備較好的三個師改編為中央陸軍師，然后剩下三個師被抽調(diào)了部隊人員和裝備后縮編為三個混成旅，并向陳敬云要了三個混成旅的編制，陳敬云也不阻攔，直接批準(zhǔn)了陸榮廷的的要求給了第六、第七、第八混成旅的編制。使得第五軍擁有了三個師，三個混成旅的部隊，總兵力高達(dá)四萬余人。